崇明东滩鸟类国家级自然保护区位于长江入海口，崇明岛的最东端，是由长江径流夹带的巨量泥沙在江海的相互作用下沉积而成，目前仍以每年80-110米的淤长速度向东海推进。它是长江口规模最大、发育最完善的河口型潮汐滩涂湿地，其南北狭，东西宽，区内潮沟密布，高、中、低潮滩分带十分明显，是亚太地区迁徙水鸟的重要通道，也是多种生物周年性溯河和降河洄游的必经通道。
       崇明东滩同时也处于全球鸟类八大迁徙路线之一的“东亚—澳大利西亚”路线中段，是候鸟迁徙路线上的重要驿站。在这里，鸟儿休憩觅食，补充能量，以恢复它们在飞行过程中损失的近60%的体重，作为候鸟们北迁的第一站和南归的最后一站，其重要性不言而喻。