2026年6月16日，东滩管理中心组织开展了保护区2026年6月下旬水鸟同步调查工作。本次调查覆盖了保护区自然滩涂、生态修复区和上实湿地公园，共记录到水鸟36种6991只。
此次调查记录到鸻鹬类1263只，雁鸭类167只，鹭类627只，鸥类2581只，其他2353只。调查到数量最多的5种鸟类依次是普通燕鸥、骨顶鸡、灰翅浮鸥、黑翅长脚鹬和白鹭，达到全球1%标准的鸟类是黑脸琵鹭和普通燕鸥。此次调查记录到国家一级保护动物黑脸琵鹭153只，黑嘴鸥34只；国家二级保护动物大滨鹬312只，水雉1只。